Teppei Kinoshita
kinos****@yasun*****
2015年 3月 3日 (火) 09:11:30 JST
TO: 安永先生 木下です。お世話になっております。 ご助言ありがとうございます。 > ノイズがずいぶん大目なので、無理があるかもしれません。 承知しました。 もう少し、ノイズを減らしたサンプル画像を用意します。 すでにチュートリアルにて実施した入力画像はSN=1ですので、 ここからやや悪くして、hvp=0.1のままではギリギリ分類できない画像を作り、 前処理のパラメータや手法を変えて、分類できるようにします。 （本来は分類が正解か分からないので、正解に近づくと考えられる） > LowPassFilter以外だと、Medianフィルタ(mrcImageSmoothing)辺りが一つの候補 > です。 了解しました。 Medianフィルタでも試して、違いを見てみます。 > また、今、LowPassFilterは、expを使っていますか？それともGaussを使ってい > ますか？ > GaussのほうがしっかりとLowPassが掛かります。 現在、使用しているのはm=4ですのでGaussです。 m=3のexpも使用してみましたが、 確かにGaussの方がギザギザが取れている印象でした。 こちらを使用します。 以上により、下記の内容にて試してみます。 ・入力画像のSNは1から徐々に落として、hvp=0.1でギリギリ分類できないものを使用 ・mrcImageLowPassFilterではm=4のGaussianフィルタを用いる ・mrcImageSmoothingを使った場合も試して、違いを見る 以上、よろしくお願いします。 木下 哲平 On 2015/03/02, at 18:34, Takuo Yasunaga <yasun****@bio*****> wrote: > 木下さん > > 安永です。 > > 下記、有難うございました。 > ノイズがずいぶん大目なので、無理があるかもしれません。 > LowPassFilter以外だと、Medianフィルタ(mrcImageSmoothing)辺りが一つの候補 > です。 > > また、今、LowPassFilterは、expを使っていますか？それともGaussを使ってい > ますか？ > GaussのほうがしっかりとLowPassが掛かります。 > > 以上です。 > > On 2015/03/02 17:53, Teppei Kinoshita wrote: >> eos-documentメンバー各位 >> >> 木下 哲平です。お世話になっております。 >> 本日、3月2日(月)のEospedia編集内容を報告致します。 >> >> 【活動項目】 >> (1) PIONEチュートリアル >> (1-1) クラスター解析 >> (1-1-1) Makefile用のパラメータをPIONEで設定できるようにする >> ・パラメータ追加時にパラメータ宣言とシーケンスへの登録だけで済むように実装 >> （書き込み処理に新たに処理を追加する必要がなくなりました） >> >> (2) クラスター解析 >> (2-1) SN比が悪い（0.3 ~ 0.5程度）場合の前処理 >> 現チュートリアルの入力ファイルからSN比のみを変更した画像にて、前処理後に分類できるかを考えます >> ・サイズ32×32 >> ・角度（非面内回転4種×面内回転10種） >> >> (2-1-1) mrcImageLowPassFilterの-hvpを段々落としてみる >> -> 0.1 から 0.03(0.01刻み)まで試しましたが、分類できませんでした。 >> >> (2-1-2) mrcImageLowPassFilter以外の手法を考える >> -> Eosのコマンドより模索します >> >> (3) API説明 >> ・lmrcFETnormalizeBySD(API) +3 >> >> 【現在の編集状況と今後の予定(優先降順)】 >> チュートリアル: クラスター解析にて前処理の方法を考える >> PIONEチュートリアル, TIPS: PIONEのメソッド一覧の使用例を挙げる >> PIONE-Webclient: 新しい操作説明となる場合に実行例を追記する >> API説明: 715件 >> 英語化: メインページ周り >> FAQ: 随時追記 >> >> 【次回の予定】 >> クラスター解析の前処理にてフィルタリングの方法を考えます。 >> >> 以上、よろしくお願いします。 >> >> 木下 哲平 >> > > > -- > Takuo Yasunaga > Kyushu Institute of Technology > 680-4 Kawazu, Iizuka, Fukuoka, 820-8502, JAPAN >
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