1.8.1の重要な変更 (Glang-devel) - G-language

g.

v.1.8.1は結構大きな変更がたくさんありますが、もう一つ重要な変更 
です。
＃バックワードコンパチは完璧なので、昔のコードはそのまま動きます。

G::IOクラス（旧G::Skyline）が実質 new G()の時のコン 
ストラクタとして
はたきますが、このG::IOクラスが最後に生成されたインスタン 
スの
ポインタを保持するようにしました。このポインタ自体は、
  lastInstance G()
で取り出す事ができます（事実上は$G::IO::thisだが 
private）。

で、SubOpt::opt_as_gb()が引数を取らない場合、opt_as_gb 
()は自動的に
lastInstance G()の値を返します。

これを利用すると、Odyssey関数を使う上で$gbという変数 
を作る必要
すらなくなり、以下のような気持ち悪いことができます。
Perl的には気持ち悪いですが、”G language"的にはだいぶ言 
語っぽく
なってきました：）

[gaou ＠ neo ~]$ G

              __/__/__/__/__/__/__/__/__/__/__/__/__/__/__/__/__/__/ 
__/__/__/

                    G-language  Genome Analysis Environment v.1.8.1

                              http://www.g-language.org/

               Please cite:
                  Arakawa K. et al. (2003) Bioinformatics.
                  Arakawa K. et al. (2006) Journal of Pestice Science.

               License: GNU General Public License
               Copyright (C) 2001-2008 G-language Project
               Institute for Advanced Biosciences, Keio University,  
JAPAN

              __/__/__/__/__/__/__/__/__/__/__/__/__/__/__/__/__/__/ 
__/__/__/

G > load ecoli

Accession Number: NC_000913

   Length of Sequence :   4639675
            A Content :   1142228 (24.62%)
            T Content :   1140970 (24.59%)
            G Content :   1176923 (25.37%)
            C Content :   1179554 (25.42%)
               Others :         0 (0.00%)
           AT Content :    49.21%
           GC Content :    50.79%

G > gcskew
[ecoliのグラフがでてくる]

G > load bsub

Accession Number: NC_000964

   Length of Sequence :   4214630
            A Content :   1187714 (28.18%)
            T Content :   1192801 (28.30%)
            G Content :    914988 (21.71%)
            C Content :    919127 (21.81%)
               Others :         0 (0.00%)
           AT Content :    56.48%
           GC Content :    43.52%

G > gcskew
[bsubのグラフがでてくる]

Kazuharu Arakawa, Ph.D.
Institute for Advanced Biosciences, Keio University
252-8520 Japan   Tel/Fax: +81-466-47-5099

G-language

[Glang-devel] 1.8.1の重要な変更