[Knob-dev 21] BLAST実験

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Koichi Minamijima minam****@mahor*****
2004年 6月 7日 (月) 17:34:27 JST


南島です。
#何度もすいません。

>>NTFSにデータベースを入れて、blast しまくるという実験もありうると
>>思いますが、そこまで勇気がないというか、マシンがありません。

ウチに、特に使用してなくて、データが壊れても痛くない(HDに逝かれるのは
痛いですが、)
PCがありますので、やれないこともないと思います。
できれば数時間以上、あるいは数日働かせっぱなしにしたい所ですが、
データベースと配列はどんなのを使うと良いでしょうか?
BLASTだけでそんだけやるとなると相当な数のquery配列が必要になりますよね。
まあ、その方が、ファイル単位でのread/writeが増えるので実験には適してい
ますが。
・・それともそんな長時間かける必要ないでしょうか。

アドバイスいただけると助かります。



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