バージョン 0.5.5 をリリースしました。
原子座標を修正したあとの MM/MD の不具合を修正。
wrap_unit_cell コマンドの不具合を修正。
単位格子が定義されているときに、周期的なイメージを表示する機能を実装。
周期境界条件での vdW／静電力計算の不具合を修正。
mbsf ファイルにスケール、配向などの表示に関する設定を保存。
MD パラメータがない分子に他の分子からのパラメータをペーストできない不具合を修正。
GaussianW の fch(k) ファイルが読めない不具合を修正。また、拡張子 ".fch" を Gaussian Checkpoint File として認識するよう設定。
Version 0.5.5 is out.
Incomplete MM/MD re-initialization after modification of coordinates was fixed.
The Ruby command wrap_unit_cell now works correctly.
Periodic images can be displayed when a unit cell is defined.
Wrong calculation of vdw/elect forces under periodic boundary conditions was fixed.
The native format (mbsf) now preserves the display conditions, such as scale, orientation etc.
Pasting MD parameters to a molecule with no parameters now works correctly.
Importing GaussianW fch(k) files was not working; fixed. The extension ".fch" is now recognized as a Gaussian formatted checkpoint files.
Fork