POPFile(自動メールフィルター)の日本語化

「お試し版」ということですので、クイック POPFile を
お使いということでしょうか？
http://quickpopfile.jp/

こちらは無料で提供されている POPFile のサポート
フォーラムですので、クイック POPFile 固有の問題に
ついては検証・対策は難しいかもしれません。

「メールの冒頭が文字化け」ということですが、具体的に
どのような症状なのでしょうか。これだけの情報では
どこで何がどう文字化けしているのか判断がつきません。

・お使いの POPFile（クイック POPFile のバージョン）
・お使いのメールクライアントの名称とバージョン
・お使いのブラウザの名称とバージョン

についてまず教えていただけますでしょうか。

また、「メールの冒頭が文字化け」について、

・メールクライアントで受信したメールについて文字
　化けが発生するのかどうか
・あるいは、POPFile のユーザーインタフェース
　（もしくはクイック POPFile のインタフェース）で
　文字化けが発生するのか
・「冒頭」というのは具体的にどの場所なのか（ヘッダ
　部分なのか本文なのか）
・すべてのメールについて文字化けが発生するのか
・POPFile（あるいはクイック POPFile）を使用して
　いない場合には問題がないのかどうか

などについてご確認ください。

また、文字化けの内容につきまして、差し支えない
範囲で結構ですので具体的にどういう表示になって
いるかを教えていただけると助かります。